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Knowl. Managt. Aquatic Ecosyst.
Number 401, 2011
European Crayfish: food, flagships and ecosystem services
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Article Number | 08 | |
Number of page(s) | 8 | |
DOI | https://doi.org/10.1051/kmae/2011021 | |
Published online | 18 May 2011 |
Short communication
Cross-amplification of microsatellite loci in the endangered stone-crayfish Austropotamobius torrentium (Crustacea: Decapoda)
Amplification croisée de locus microsatellites chez l’écrevisse des torrents Austropotamobius torrentium (Crustacea: Decapoda)
(1)
“Grigore Antipa” National Museum of Natural History, Molecular
Biology Department, Sos. Kiseleff
No. 1, 011341
Bucharest,
Romania,
popaluis@antipa.ro
(2)
Department of Biochemistry and Molecular Biology, University of
Bucharest, Romania
Received:
17
November
2010
Revised:
11
February
2011
Accepted:
14
March
2011
The major aim of this study is to describe the first microsatellite loci for the stone-crayfish (Austropotamobius torrentium), by cross-species amplification. Austropotamobius torrentium is a priority species in the EU Habitats Directive and it needs effective conservation management efforts throughout Europe. We tested cross-species amplification of 55 decapod microsatellite primer pairs in A. torrentium and only ten of these loci, from relatively close related species, yielded PCR products of expected sizes. Five of the ten microsatellites proved to be polymorphic (allele numbers ranging from 4 to 14 in a set of 35 individuals). Three of the loci exhibited departure from Hardy-Weinberg equilibrium which could be explained by the presence of null alleles. A forth locus exhibiting HWE deviation, but no null alleles, suggest the possible presence of population substructure of the species in the investigated area. These microsatellite markers are useful for population genetic studies of stone-crayfish.
Résumé
Le but principal de cette étude est de décrire les locus microsatellites chez l’écrevisse des torrents (Austropotamobius torrentium), par amplification croisée. Austropotamobius torrentium est une espèce prioritaire de la Directive Habitats de l’Union Européenne qui nécessite une efficace gestion de conservation à travers l’Europe. Nous avons testé l’amplification croisée de 55 paires de primer microsatellites de décapodes chez A. Torrentium et seulement dix de ces locus, d’espèces relativement proches, ont abouti à des résultats PCR. Cinq des dix microsatellites se sont avérés polymorphes (nombres d’allèles de 4 à 14 pour un lot de 35 individus). Trois de ces locus montraient un écart par rapport à l’équilibre de Hardy-Weinberg, qui pourrait s’expliquer par la présence d’allèles nuls. Un quatrième locus présentant une déviation HWE, mais pas d’allèles nuls, suggère la présence possible d’une sous-structure de cette espèces dans la zone étudiée. Ces marqueurs microsatellites sont utiles pour les études de génétique des populations de l’écrevisse des torrents.
Key words: polymorphism / cross-species / spatial-scale / conservation / population genetics
Mots clés : polymorphisme / amplification croisée / échelle spatiale / conservation / génétique de population
© ONEMA, 2011
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