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Bull. Fr. Pêche Piscic.
Number 380-381, 2006
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Page(s) | 977 - 990 | |
DOI | https://doi.org/10.1051/kmae/20060977 | |
Published online | 31 October 2012 |
FIRST ANALYSIS OF GENETIC VARIABILITY IN CARINTHIAN POPULATIONS OF THE WHITE-CLAWED CRAYFISH AUSTROPOTAMOBIUS PALLIPES
PREMIÈRE ANALYSE DE LA VARIABILITÉ GÉNÉTIQUE DES POPULATIONS D’ÉCREVISSE À PATTES BLANCHES AUSTROPOTAMOBIUS PALLIPES EN CARINTHIE
(1) Research Centre for Agriculture and Forestry Laimburg. Laimburg 6, 39040 Auer/Ora
(BZ), Italy. E-Mail: sanja.baric@provinz.bz.it
(2) Institute of Zoology and Limnology. University of Innsbruck, Technikerstr. 25, 6020
Innsbruck, Austria.
(3) EB&P - Umweltbüro Klagenfurt GmbH. Bahnhofstr. 39, 9020 Klagenfurt, Austria.
Received:
16
June
2005
Accepted:
7
November
2005
Several authors have speculated about the nativeness of the white-clawed crayfish (Austropotamobius pallipes) in the Austrian province of Carinthia, since this is the only occurrence of the species within the Danube river system. Phylogeographic analyses based on mitochondrial DNA sequences showed that Carinthian A. pallipes are closely related to specimens from Slovenia, Croatia and north-eastern Italy. These analyses additionally pointed to an absence of variability among populations in Carinthia. In the present study a larger number of individuals sampled from three different brooks in western Carinthia was investigated by analysing sequences of the mtDNA cytochrome c oxidase gene (COI), microsatellite DNA and microsatellite length variation in the nuclear ribosomal DNA internal transcribed spacer region (ITS1). Not only COI sequences revealed low degrees of genetic variability, but also microsatellite loci displayed low allelic diversity and low heterozygosity. Analysis of ITS1 microsatellite length variation in turn showed high levels of intragenomic variability, since single individuals manifested up to seven distinct fragments. Microsatellite data and ITS1 microsatellite length variation analyses also revealed significant differentiation among some population pairs. Since genetic divergence was mainly based on differences in allele frequencies and not on the occurrence of alternative alleles, we assume that Carinthian populations became isolated rather recently and that the occurrence of this species in this region is more likely to be a result of human introduction than of natural postglacial colonisation.
Résumé
Plusieurs auteurs ont spéculé sur l’origine de l’écrevisse à pattes blanches (Austropotamobius pallipes) de la province autrichienne de Carinthie, parce que c’est la seule référence à la présence de l’espèce dans le bassin du Danube. Les analyses phylogéographiques basées sur des séquences de l’ADN mitochondrial montrent que A. pallipes de Carinthie est étroitement liée aux spécimens de Slovénie, Croatie et du nord-est de l’Italie. De plus, ces analyses mettent en évidence l’absence de variabilité au sein de populations de Carinthie. Dans la présente étude un plus grand nombre d’individus prélevés dans trois ruisseaux différents de l’ouest de la Carinthie a été étudié par analyse des séquences du gène mitochondrial cytochrome c oxidase (COI), d’ADN microsatellite et des variations de la longueur des microsatellites au niveau des régions intergéniques transcrites (ITS1) internes des ribosomes nucléaires. Non seulement les séquences du COI révèlent des faibles niveaux de variabilité génétique, mais également les loci microsatellites montrent une faible diversité allélique ainsi qu’une faible hétérozygotie. Par contre les analyses des variations des longueurs des microsatellites ITS1 ont montré des hauts niveaux de variabilité intragénomique, puisque jusqu’à sept fragments distincts ont été révélés pour un seul individu. Les analyses des données microsatellites et des variations de la longueur des microsatellites ITS1 révèlent également une différence significative pour certaines paires de populations. Puisque la divergence génétique est principalement basée sur les différences des fréquences alléliques et non sur les occurrences des allèles alternatifs, nous pouvons affirmer que les populations de Carinthie ont été isolées récemment et que la présence de cette espèce dans cette région est plutôt la conséquence due d’une introduction humaine que d’une colonisation naturelle postglaciaire.
Key words: Austropotamobius pallipes / mitochondrial DNA sequences / 16S rRNA gene / cytochrome c oxidase / microsatellite DNA / ITS1 microsatellite length variation
Mots clés : Austropotamobius pallipes / séquences d’ADN mitochondrial / gène 16S rRNA / cytochrome c oxidase / ADN microsatellite / variation de longueur des ITS1 microsatellites
© ONEMA, 2006
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