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Bull. Fr. Pêche Piscic.
Number 385, 2007
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Page(s) | 17 - 24 | |
DOI | https://doi.org/10.1051/kmae:2007002 | |
Published online | 01 April 2008 |
LACK OF SPECIFICITY OF THE MOLECULAR DIAGNOSTIC METHOD FOR IDENTIFICATION OF APHANOMYCES ASTACI
MANQUE DE SPÉCIFITÉ DE LA MÉTHODE DE DIAGNOSTIC MOLÉCULAIRE POUR L’IDENTIFICATION D’APHANOMYCES ASTACI
1
Departamento de Micología, CSIC, Real Jardín Botánico, Plaza Murillo 2, 28014 Madrid, Spain.
2
Department of Comparative Physiology, Uppsala University, Norbyvägen 18A, S-752 36 Uppsala, Sweden
Corresponding author: Departamento de Micología, CSIC, Real Jardín Botánico, Plaza Murillo 2, 28014 Madrid, Spain, Phone: +34-91-4203017; Fax: +34-91-4200157. E-Mail : dieguez@rjb.csic.es
Received:
7
December
2006
Accepted:
15
May
2007
A recent PCR-test developed for identification of Aphanomyces astaci, the organism responsible for crayfish plague, provided false positives for Aphanomyces frigidophilus, Aphanomyces repetans, and some Saprolegnia spp. Real-time PCR showed that with the designed primers, A. astaci and A. frigidophilus cannot be distinguished. The results of this study show that this particular crayfish plague PCR-test ought to be improved and that molecular-based techniques need to be contrasted to histological evidences and disease history.
Résumé
Un test PCR récemment développé pour identifier Aphanomyces astaci, organisme responsable de la peste de l’écrevisse, a donné des faux positifs pour Aphanomyces frigidophilus, Aphanomyces repetans, et pour quelques Saprolegnia spp. La PCR en temps réel montre, qu’avec les "primers" redessinés, A. astaci et A. frigidophilus ne peuvent pas être distingués. Les résultats de cette étude montrent que ce test PCR, conçu pour identifier la peste de l’écrevisse, doit être amélioré et que les techniques moléculaires doivent être confortées par des évidences histologiques et en fonction de l´histoire de la maladie.
Key words: Oomycetes / crayfish plague / ITS / crayfish / Conservation / invasive species
Mots clés : Oomycètes / peste de l’écrevisse / ITS / écrevisse / conservation / espèces invasives
© ONEMA, 2007
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