Research Article

Molecular characterization of the noble crayfish (Astacus astacus L.) population from Pomeranian lakes (north-western Poland) based on mitochondrial DNA

Caractérisation moléculaire de la population écrevisse à pattes rouges (Astacus astacus L.) des lacs de Poméranie (nord-ouest de la Pologne) à partir de l’ADN mitochondrial

¹ Cell Biology Department, Faculty of Biology, University of Szczecin, Wąska 13 str., 70-415 Szczecin, Poland
² The Center for Molecular Biology and Biotechnology, Faculty of Biology, University of Szczecin, Wąska 13 str., 70-415 Szczecin, Poland
³ Department of Aquaculture, Faculty of Food Sciences and Fisheries, West Pomeranian University of Technology Szczecin, Kazimierza Królewicza 4, 71-550 Szczecin, Poland
⁴ Department of Ecology and Environment Protection, Faculty of Biology, University of Szczecin, Wąska 13, 71-415 Szczecin, Poland

^⋆ Corresponding author: skuza@univ.szczecin.pl

Received: 15 June 2015
Revised: 27 December 2015
Accepted: 31 December 2015

Abstract

The genetic variability between individuals from five crayfish (Astacus astacus L.) populations was determined. The analysis was based on sequences variations of mitochondrial DNA (cytochrome oxidase subunit I (COI) and 16S ribosomal DNA. Mitochondrial DNA sequences are widely used to detect genetic variation within and between populations. Data analysis revealed the existence of two COI haplotypes – most common haplotype Hap01 and one new haplotype, differed only in one substitution. Analysis of the 16S rDNA sequences obtained showed no differences in nucleotide composition. The results of the analysis are important part of project “Active protection of noble crayfish in lakes of Pomeranian Complex Landscape Parks” financed by Financial Mechanism of the European Economic Area 2014–2016.

Résumé

La variabilité génétique entre les individus de cinq populations d’écrevisses à pattes rouges (Astacus astacus L.) a été déterminée. L’analyse a été basée sur les variations de séquences de l’ADN mitochondrial (sous-unité de la cytochrome oxydase I (COI) et l’ADN ribosomal 16S. Les séquences d’ADN mitochondrial sont largement utilisées pour détecter une variation génétique au sein et entre les populations. L’analyse des données a révélé l’existence de deux haplotypes COI – l’haplotype le plus commun Hap01 et un nouvel haplotype, différant en une seule substitution. L’analyse des séquences d’rADN 16S n’a montré aucune différence dans la composition des nucléotides. Les résultats de l’analyse sont une partie importante du projet «Protection active de l’écrevisse à pattes rouges dans les lacs des Parcs Paysagers Poméraniens» financé par le Mécanisme Financier de l’Espace Economique Européen de 2014 à 2016.