Life-forms, cell-sizes and ecological guilds of diatoms in European rivers

Formes de vie, tailles de cellule et guildes écologiques des diatomées des rivières européennes

⁽¹⁾ INRA, UMR 0042 Carrtel, 75 avenue de Corzent, 74203 Thonon, France
⁽²⁾ Université de Savoie, UMR CARRTEL, 74203 Thonon-les-Bains Cedex, France

^* Corresponing author : frederic.rimet@thonon.inra.fr

Received: 13 April 2012
Revised: 25 May 2012
Accepted: 28 May 2012

Abstract

Diatoms are a very diverse group of microalgae that encompass about 100 000 taxa. This makes an excellent bioindicator especially of rivers. The majority of biotic indices based on diatoms are constructed on species pollution-sensitivities. Nevertheless, recent studies showed the interest to use complementary metrics for biomonitoring: life-forms, cell-sizes and ecological guilds. Unfortunately, taxa memberships to such metrics are scattered in numerous floras and papers. Therefore, studies using such metrics often referred to grey literature or home-made checklists. The objective of this paper is to make available to the scientific community an important check-list of taxa frequently observed in European rivers with their memberships to these metrics. After defining these metrics, 1115 taxa were codified using Biofresh and Omnidia codes in an Excel file. Metrics memberships were then explored in a taxonomical framework. It clearly appears that metrics memberships are determined by taxonomy. Life-forms and cell sizes taxa memberships and their study in the framework of evolutionary history of diatoms is a field that is worth studying for a better understanding of diatoms ecology. Such inputs should be beneficial for the future improvement of diatom-based monitoring tools.

Résumé

Les diatomées sont un groupe très diversifié de microalgues, qui comprend plus de 100 000 taxons. Cela en fait un excellent bioindicateur, en particulier des rivières. La majorité des indices biotiques basés sur les diatomées sont construits sur les polluo-sensibilités des espèces. Néanmoins, des études récentes ont montré l’intérêt d’utiliser des métriques complémentaires pour la bioindication : les formes de vie, les tailles de cellules et les guildes écologiques. Malheureusement, l’appartenance des taxons à ces différentes métriques est souvent dispersée dans de nombreux articles et ouvrages. De plus, les études utilisant de telles métriques font souvent référence à de la littérature grise et des listes non publiées. L’objectif de cet article est de rendre disponible à la communauté scientifique une importante liste de taxons fréquemment observés dans les rivières européennes avec leur appartenance à ces différentes métriques. Après avoir défini ces métriques, 1115 taxons ont été codifiés en utilisant les codes Biofresh et Omnidia dans un fichier Excel. L’appartenance aux métriques a été explorée dans un cadre taxonomique. Il apparaît clairement que l’appartenance des taxons aux métriques est déterminée par la taxonomie. L’appartenance aux formes de vie et aux tailles de cellules et leur étude dans le cadre de l’histoire de l’évolution des diatomées est un champ qui est utile à étudier pour une meilleure compréhension de l’écologie des diatomées. De tels apports devraient être bénéfiques pour l’amélioration future des outils de bioindication basés sur les diatomées.